DNAメチル化解析(NGS)

次世代シーケンサーを用いたメチル化シトシンシーケンス

特長

  • 次世代シーケンサーにより網羅的にシトシン塩基単位でメチル化率の算出が可能
  • 解析目的に応じてMeDIP-Seq解析やRRBS解析も提供可能
  • 特定領域に絞った多検体解析では、プライマー設計からお任せ!

サービス内容

各解析の網羅性とコストの図
※全ゲノムメチル化シーケンス解析の情報解析作業は(株)Rhelixaで実施します。
※MeDIP-Seq解析及びRRBS解析はActive Motif社で実施します。

■サービス詳細は技術資料をご覧ください(閲覧にはWEB会員ログインが必要です)。
DNAメチル化解析ウェブ会員限定資料


■チラシをご覧ください。
メチル化DNA解析サービス


オプション サンプル調製

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • マッピング結果一式
  • メチル化解析結果一式

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、「オンラインのご注文方法について」をご参照ください。
    ※オンライン注文ページはChromeで動作確認しております。それ以外のブラウザでは正しく機能しない場合があります。ご注意ください。
     また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・送付サンプルがDNAの場合には、-20℃の状態の冷凍便でお送りください。

受入サンプル

  • 参照配列情報
  • ゲノムDNA
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
横にスクロールできます
  解析方法 DNA量 濃度 純度
OD260/OD280 OD260/OD230
ゲノムDNA 全ゲノムメチル化シーケンス解析 600 ng以上 10 ng/μl以上 1.6以上
MeDIP-Seq解析 5~50 μg以上 75 ng/μl以上
RRBS解析 100 ng以上 5 ng/μl以上
特定領域バイサルファイトシーケンス解析 1 μg以上 10 ng/μl以上
組織・細胞(オプション)お問い合わせください。
  • 上記基準はヒトゲノムを解析する場合の値です。ゲノムサイズにより必要量が異なりますので別途お問い合わせください。
  • DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
  • 電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。

■サンプル送付容器について
・ゲノムDNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。
 24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

<推奨プレートおよびシール>
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・SEAL & SAMPLE Aluminium foil Lid(Biomek社, No. 538619)

ご留意事項

  • ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
    詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
  • お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。