特長
- 低い増幅バイアスが期待できるSMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2を使用
- UMIの利用により、わずか0.001％のクローン型特異的CDR3配列まで高感度に検出可能
- 比較解析、多様性指標を含む多様な情報解析を提供
サービス内容
供与細胞またはtotal RNAから、TCRα、TCRβ受容体領域についてSMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2を用いてシーケンスライブラリーの調製を行い、次世代シーケンサーを用いて塩基配列を解析します。目的の解析領域に応じて、NovaSeqまたはMiSeqでの解析提案が可能です。得られた塩基配列をもとに多様性の解析を行います。
■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。
■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。
オプション サンプル調製
価格・納期
価格・納期は検体数やご依頼内容によって変わりますので、別途お問い合わせください。
なお、TCRαのみ、TCRβのみの解析も可能です。
なお、TCRαのみ、TCRβのみの解析も可能です。
納品物
- 作業報告書
- シーケンスデータ一式
- 解析データ一式
ご注文方法
以下のフォーマットにご記入のうえ、電子メールにてこちらへご送付下さい。
- 次世代シーケンス(NGS)解析依頼書（Excel）
-
臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙（Excel）
※臨床検体・細胞を送付いただく場合は、受託サービスをお申込みいただく前に、「臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙」にご記入の上、弊社へお送りください。 弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。
「臨床検体のお取り扱いについて」の詳細はこちらをご参照ください。
受入サンプル
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
※対象はヒト由来検体のみとなります。
※末梢血、組織等にてご依頼の場合は、別途RNA抽出費用を申し受けます。
※血液検体の場合、ヘパリンを含む採血管は使用しないでください。
※組織は採取後速やかに－80℃で保存し、十分な量のドライアイスを入れて弊社へご発送ください。
迅速な凍結保存が困難な場合は、RNAlaterに浸漬するなど、RNAが分解しないようにして保存してください。
シーケンスライブラリーの作製の際には、サンプル中のT細胞由来のtotal RNA量が重要となります。
末梢血単核細胞以外の検体につきましては、以下の検体中のおよそのT細胞の存在比を目安に必要サンプル量をご準備ください。
■サンプル送付容器について
・RNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。
24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates (Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・WATSON タイタースティック HCフィルム（547-KTS-HC）
| 送付物 | サンプル量 | 濃度 | 液量（目安） | 純度 | |
| OD260／OD280 | OD260／OD230 | ||||
| total RNA （T細胞） |
300 ng以上 | 20 ng/μl以上 | 15 μl以上 | 1.6以上 | |
| total RNA （全血・組織由来） |
3 μg以上 | 150 ng/μl以上 | 20 μl以上 | 1.6以上 | |
| 組織検体 | 100 mg以上 | ― | |||
| 血液検体 | 全血 3 ml以上 | ― | |||
※末梢血、組織等にてご依頼の場合は、別途RNA抽出費用を申し受けます。
※血液検体の場合、ヘパリンを含む採血管は使用しないでください。
※組織は採取後速やかに－80℃で保存し、十分な量のドライアイスを入れて弊社へご発送ください。
迅速な凍結保存が困難な場合は、RNAlaterに浸漬するなど、RNAが分解しないようにして保存してください。
シーケンスライブラリーの作製の際には、サンプル中のT細胞由来のtotal RNA量が重要となります。
末梢血単核細胞以外の検体につきましては、以下の検体中のおよそのT細胞の存在比を目安に必要サンプル量をご準備ください。
| 検体種別 | T細胞の存在比の目安 |
| セルソーター等で単離されたT細胞 | ＞90％ |
| 末梢血単核細胞（PBMC） | 40～60％ |
| 全血 | 20～40％ |
| リンパ組織 | 40～60％ |
| その他組織 | ＜10％ |
■サンプル送付容器について
・RNAサンプルは1.5 mlチューブでご送付ください。
24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
＜推奨プレートおよびシール＞
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates (Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・WATSON タイタースティック HCフィルム（547-KTS-HC）
ご留意事項
- ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。 - 解析サンプルやその他供与物は別途定めている場合を除き、解析終了後弊社で3ヵ月は保管いたします。
- 注意事項
- 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
- 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
- ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
