特長
- エピストラ社の自律型AI Agent 「Epistra Accelerate - AI Scientist」を用いたクラウド型AI解析システムを用いた高次データ解析
- 事前のヒアリング情報と解析データを入力後、最短1週間でレポート納品
- ご興味のある細胞種の特性を深堀りすることで、新規知見の探索、埋もれているデータの再利用に活用可能
- 解析データに加えて、実施した解析方法および結果・考察を体系的にまとめた解析結果報告書を納品
サービス内容
シングルセル解析または空間解析データを対象に、高度な解析を探索的に実行し、従来は困難だった新たな知見の発見を支援するクラウド型AI高次データ解析です。解析データおよび事前に研究目的をヒアリングした情報をEpistra Accelerate - AI Scientist*に投入することで、解析計画の立案（Planning Agent）、解析の実行・レポート作成（Analysis Agent）を、最短1週間で行います。
解析依頼書、研究目的を事前にお伺いしたヒアリングシート、およびデータ一式が揃った時点で、Epistra Accelerate - AI Scientistに情報を投入します。Planning Agentによる解析計画が立案された後Analysis Agent により、解析の実行・結果報告書の作成を行います。解析結果については、タカラバイオの専門家によるファストチェックを行ったうえで、最短1週間で納品いたします。
解析フロー
解析依頼書、研究目的を事前にお伺いしたヒアリングシート、およびデータ一式が揃った時点で、Epistra Accelerate - AI Scientistに情報を投入します。Planning Agentによる解析計画が立案された後Analysis Agent により、解析の実行・結果報告書の作成を行います。解析結果については、タカラバイオの専門家によるファストチェックを行ったうえで、最短1週間で納品いたします。
* Epistra Accelerate - AI Scientist とは
Epistra Accelerate - AI Scientist は、エピストラ株式会社が開発した生命科学に特化した自律型AI Agentです。解析の目的とデータを提供いただくだけで、計画立案・データ統合・高度な解析実行・仮説生成・レポート作成までを一貫して対応します。
Epistra Accelerate - AI Scientist は、エピストラ株式会社が開発した生命科学に特化した自律型AI Agentです。解析の目的とデータを提供いただくだけで、計画立案・データ統合・高度な解析実行・仮説生成・レポート作成までを一貫して対応します。
■解析例（AI駆動シングルセル情報解析）：肺がんscRNA-Seq データ解析
入力情報
解析依頼書：
- 肺がん組織における（1）腫瘍細胞の不均一性、および（2）腫瘍免疫状態を評価し、これらの特徴と臨床データとの関連を明らかにしたい。
- 腫瘍上皮細胞に、基底細胞様・増殖性・角化型・EMT様などの異なる細胞状態が存在するかを確認したい。それぞれの細胞状態がどの程度含まれるか、および各状態を特徴づける遺伝子発現を把握したい。
- T細胞集団内で免疫状態、特に免疫抑制または免疫回避を示唆する特徴が認められるかを検討したい。CD8陽性T細胞の構成と、細胞傷害性および疲弊の状態を評価したい。
- 肺がんscRNA-Seq データ（RDS形式Seuratオブジェクト）
解析フロー
解析結果
上皮細胞のサブクラスタリング結果。a：10個のサブクラスターを、基底細胞様・増殖性・角化型・EMT様の4状態のうち、最もスコアが高い状態に分類して着色して示す。b-e：各状態に対応するマーカー遺伝子群の平均発現量をUMAP上に示す。f：各状態の構成比。
結果報告書
肺がんscRNA-Seqデータ解析 結果報告書■解析例（AI駆動空間情報解析）：大腸がん空間トランスクリプトーム解析
入力情報
解析依頼書：
- 大腸がん組織における免疫微小環境の空間的な多様性を解析したい。
- 検体情報：大腸癌・腺癌・浸潤性／腫瘍60%、壊死3%、正常・非腫瘍17%、その他20%／KRAS G12V変異陽性／T4aN1bM0, Stage IIIB
- 上皮細胞を正常と腫瘍に分類し、腫瘍細胞のサブタイプや状態を評価する。
- T細胞・B細胞・マクロファージなどを分類し、腫瘍細胞との空間的な関係から免疫微小環境の多様性を評価する。
- 遺伝子発現に加えて空間座標およびH&E画像を利用したクラスタリングを検討し、免疫微小環境を適切に表現できる解析条件を評価する。
- 解析で得られた特徴的な免疫微小環境をH&E画像上にマッピングして可視化する。
- 大腸がん空間トランスクリプトームデータ（シングルセルRNA＋空間座標）（RDS形式Seuratオブジェクト）
- H&E画像（OME-TIFF形式）
解析フロー
解析結果
上皮細胞における転写状態の空間的不均一性解析結果。a：H&E染色画像上における主要な上皮転写状態の局所的な濃縮領域を示す。b：各状態について効果量の上位・下位各5領域の濃縮および減少を、各領域における対象状態のスポット数と上皮スポット総数を併せて示す。
結果報告書
大腸がん空間トランスクリプトーム解析 結果報告書
価格・納期
| サービス項目 | 参考価格 | 納期 |
|---|---|---|
| AI駆動シングルセル情報解析 | ￥500,000 | データ受領から1週間～ |
| AI駆動空間情報解析 | ￥1,500,000 |
納品物
- 結果報告書
- 解析データ一式
■クラウド解析サービスご利用環境について
クラウド解析サービスは、Google Chromeの使用を推奨いたします。Firefox、Microsoft Edge、Safari（いずれも2021年4月時点での最新版）でも動作確認を行っておりますが、動作自体を保証するものではありません。
ご注文方法
※お見積りをご用意いたしますので、事前にお問い合わせください。
- データ送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
-
依頼書記載の検体名称と、実際の送付検体に記載の名称は必ず一致させてください。
※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。
受入データ
■シングルセルデータ
■空間データ
※弊社で実施したシングルセル解析または空間解析データの場合は事前にご相談ください。
-
Seuratオブジェクト（RDS形式）またはAnnDataオブジェクト（h5ad形式）
※カウントデータからの解析にも対応可能です。ご相談ください。
■空間データ
- 遺伝子発現データ：Seuratオブジェクト（RDS形式）またはAnnDataオブジェクト（h5ad形式）
-
組織画像：H&E染色画像（OME-TIFF形式）
※遺伝子発現データには空間座標情報を含めてください。
※その他のデータ形式についてはご相談ください。
※弊社で実施したシングルセル解析または空間解析データの場合は事前にご相談ください。
［データ送付先］
Boxによるクラウドを利用したデータ送付をお願いいたします。
詳細については、ご依頼後に担当者からご連絡差し上げます。
Boxによるクラウドを利用したデータ送付をお願いいたします。
詳細については、ご依頼後に担当者からご連絡差し上げます。
ご留意事項
- 本解析は、解析工程の一部をエピストラ株式会社へ再委託し、同社が提供するクラウド型AI解析システム「Epistra Accelerate - AI Scientist」を利用します。
- お預かりした受入データおよび解析に必要な情報は、Epistra Accelerate - AI Scientistによる解析のため、クラウド環境上で処理されます。
- Epistra Accelerate - AI Scientistは、ご提供いただいたデータ、解析目的およびヒアリング情報に基づき、解析計画の立案および解析手法の選択・実行を自律的に行います。AIの特性上、同一または類似する入力データであっても、解析計画、解析過程または出力内容が完全に同一となることを保証するものではありません。
- 解析結果は、ご提供いただく研究目的、解析上の関心事項およびヒアリング内容に依存します。新規知見、統計学的に有意な結果または特定の仮説を支持する結果が得られることを保証するものではありません。
- 新規性の高い試料、特殊なデータ形式または解析目的については、十分な解析結果が得られない場合があります。
- AIが生成した解析結果および報告書については、当社担当者が内容を確認したうえで納品しますが、AIによる解析にはデータ形式の誤認、解析方法の不適切な選択、解釈の誤り等が生じる可能性があります。
- AIが提示する文献情報、考察および仮説は研究上の参考情報であり、その妥当性を保証するものではありません。
- 本サービスによる解析結果は研究用途を目的とするものであり、疾病の診断、治療方針の決定その他の医療行為に使用することを目的としたものではありません。
- ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わる検体は、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。 詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。
- 受入データには個人情報が含まれていないことをご確認ください。
この製品を見た人は、
こんな製品も見ています
- 注意事項
- 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
- 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
- ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
