メタゲノムDNAからショットガンライブラリーを作製後、イルミナシーケンサーを用いてシーケンスデータを取得します。取得したリードについて、データベース配列へマッピングすることで、菌種組成、また同時にアセンブルにより菌叢の持つ代謝機能を明らかにします。Bacteriaだけでなく
Archaea、Viruses(二本鎖DNAウイルス)、
fungi、
Microbial eukaryotes(藻類やプロトゾア)も解析対象に含まれます。
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マイクロバイオーム解析

- 生体サンプル等
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サンプル量 |
温度 |
糞便 |
目安:200 mg(小豆大)程度* |
冷凍 |
* 採取・送付方法について事前にお問い合わせください。
- ゲノムDNA
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
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サンプル量 |
濃度 |
液量(目安) |
純度 |
OD260/OD280 |
OD260/OD230 |
ゲノムDNA |
200 ng以上 |
5 ng/μl以上 |
40 μl以上 |
1.6以上 |
- 上記基準に満たない場合や土壌などの環境サンプルの場合は、別途お問い合わせください。
- DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
- 電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。
■サンプル送付容器について
・ゲノムDNAサンプルは、1.5 mlチューブでご提供ください。
24検体以上の場合は96 well plateでご提供ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
<推奨プレートおよびシール>
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・タイタースティックHCフィルム(WATSON社, No. 547-KTS-HC)