シングルセル空間解析

• CosMx SMI（Bruker Spatial Biology社）またはXenium In Situ（10x Genomics社）を用いた空間マルチオミックス解析
• サブセルラーレベルの高解像度空間解析データを取得
• 組織中での細胞の動態や細胞間相互作用の解析に最適
• FFPEブロックを送付いただくだけで情報解析までの全工程をサポート

• CosMx SMI
FFPEブロックから解析用の切片スライドを作製し、cyclic in situ hybridization技術^＊により6,000以上のRNAまたは64以上のタンパク質を検出します。出力データは専用の解析プラットフォーム（AtoMx Spatial Informatics Platform (SIP) ：Bruker Spatial Biology社）で解析します。


＊ 対象のRNAまたはタンパク質（タンパク質の場合は抗体に付与したオリゴ）にハイブリダイズさせたプローブを検出する際に、「レポーターのハイブリダイズ」と「蛍光色素の遊離」を繰り返すことで、大量の分子を識別することが可能な技術。詳細は下記の解析フロー概略図をご確認ください。

※スライド作製等の一部作業は病理会社へ委託します。
※FFPEスライドでの受付も可能です。
※対応生物種はヒト・マウスのみ

■解析フロー概略図



• Xenium In Situ
FFPEブロックから解析用の切片スライドを作製し、padlock probeとrolling circle amplificationケミストリー^＊により約5,000のRNAを検出します。出力データは専用の解析プラットフォーム（Xenium Onboard Analysis：10x Genomics社）で解析します。


＊5’末端側と3’末端側に標的となる遺伝子の相補配列を、またその間に蛍光物資が結合する配列を持つ南京錠型のプローブ（Padlock probe）を標的mRNA配列にハイブリダイズさせ、その両端をライゲーションすることで環状のプローブを形成させます。環状プローブをRolling circle amplificationによって何度も増幅することで、蛍光物資が結合する配列を多数持つDNA配列を合成し、これを蛍光によって検出します。

※スライド作製等の一部作業は病理会社へ委託します。
※FFPEスライドでの受付も可能です。
※対応生物種はヒト・マウスのみ




Image provided by 10x Genomic




・タカラバイオの空間解析プラットフォーム比較

・CosMx SMI

・Xenium In Situ

・CosMx SMI

・Xenium In Situ

• CosMx SMI
• 作業報告書
• 解析データ（解析結果、ビューアー）

■納品データ例

AtoMx解析結果例
AtoMxの解析結果を納品します。



細胞アノテーション表示
細胞種などで細胞を色分けして表示します。



転写産物表示
細胞内の分子の局在を確認できます。



タカラバイオ・オリジナルビューアー解析結果例
異なる細胞アノテーション情報や複数の遺伝子発現量を同時に並べて表示することが可能です。

• Xenium In Situ
• 作業報告書
• 解析データ

■納品データ例

Xenium Explore解析結果例

遺伝子発現情報から推定した細胞種ごとに異なる色で塗分けて表示します。
また、検出された遺伝子が細胞中のどの局在で発現していたかをドットで表示します。

• オンライン注文
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• メール注文
  ・検体送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
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  • シングルセル空間解析　発注依頼書（Excel）


• 検体送付
  ・検体ならびに依頼書（オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物）を下記検体送付先へご送付ください。
  ・検体は容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
  ・FFPEブロック／スライドは、冷蔵にて保管・ご送付ください。

・ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。