空間プロテオーム解析（Spatial Proteomics）

• Xenium In Situとの空間マルチオミクス解析が可能
• 40種類以上のマーカータンパク質を同時解析
• 高い精度と幅広い定量域を持ったシングルセルイメージングを実現
• FFPE検体・凍結組織検体に対応

凍結組織またはFFPEブロックから解析用の切片スライドを作製し、金属標識抗体による染色を行った後、IMC（Imaging Mass Cytometry）技術を用いて、Hyperion XTi（Standard BioTools社）でスライドをスキャンします。抗体に結合した金属ラベルの情報を読み取ることで、細胞やマーカータンパク質の空間的な分布を高精度に可視化することが可能です。取得されたデータは、専用ビューアー「MCD Viewer」（Standard BioTools社）を用いて視覚的に確認できます。

また、Xenium In Situ（10x Genomics社）の解析後スライドに対して抗体染色を行うことで、同一スライド上でRNAとタンパク質の両方を解析することも可能です。さらにHyperion XTiの出力データは、Xenium Explorer（10x Genomics社）の形式に変換することで、同一ビューアー上で統合的に確認できます。

※スライド作製等の一部作業は病理会社へ委託します。
※一部検体の染色およびHyperion XTiの測定作業はStandard BioTools社で実施します。

■解析作業フロー

■スキャンモードについて

■抗体パネル

• 使用パネル
• Human Immuno-Oncology IMC Panel（31抗体）
現在利用可能な最大規模のIMCパネルであり、組織全体の構造、免疫浸潤や腫瘍微小環境の評価、細胞間相互作用、単一細胞の表現型および機能マーカーを多面的に解析可能です。
• Maxpar IMC Cell Segmentation Kit (3抗体)
細胞膜の境界を明瞭に識別でき、密な組織でも高精度な細胞セグメンテーションが可能です。Human Immuno-Oncology IMC Panelに追加することで、信頼性の高い空間解析が実現します。
• 上記パネル以外にも、目的に応じたパネル設計に柔軟に対応
• 特定アプリケーションに必要な抗体のみを組み合わせた小型パネルでの解析も可能です。
• カタログ掲載の抗体から選択し、目的に応じたカスタムパネルの設計が可能です。

詳細はこちらをご確認ください。パネルデザインは事前にご相談ください。
※リンク先は社外（スタンダード・バイオツールズ社）のサイトです。

■参考

• Hyperion XTiを選ぶ5つの理由
Five reasons to choose the Hyperion XTi Imaging System




• AACR2024 発表事例
AACR 2024 Unlocking New Views in Spatial Biology with Jana Fischer

※動画は社外（YouTube）のサイトです。

• 作業報告書
• Hyperion解析画像データ
• MCD形式ファイル: 無償のMCD ViewerやMCD SmartViewerで可視化可能
• TIFF形式ファイル: 無償のXenium Explorerで可視化可能
※オプションのXenium In Situの納品物はこちらをご参照ください。

■解析事例

• 画像データはサイズが大きいためダウンロードに時間を要する場合がございます。
  事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。
  推奨回線速度計測サイトはこちらから
• 回線速度が110 Mbpsの場合：500 GByteのダウンロードに10時間、50 Mbpsの場合：23時間が目安です。
• 画像データサイズの目安は数GByte／検体となります。
• 150 GByteを超える大量のデータをダウンロードする際にはBox Drive（デスクトップ用アプリ）をインストールしてご利用ください。
• ご依頼内容によっては対応が難しい場合がございます。その場合は、メディア納品（HDD等、別途料金￥15,000（税別）／件）への変更をご案内します。
• 事前のテストをご希望の場合はご連絡ください。

• メール注文
  ・検体送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
  ・依頼書記載の検体名称と、実際の送付検体に記載の名称は必ず一致させてください。
  ※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。
  
  • 次世代シーケンス（NGS）解析　発注依頼書（Excel）
  • 臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙（Excel）
    ※臨床検体・細胞を送付いただく場合は、受託サービスをお申込みいただく前に、「臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙」にご記入の上、弊社へお送りください。弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。
    「臨床検体のお取り扱いについて」の詳細はこちらをご参照ください。


• 検体送付
  ・臨床検体の場合、検体送付前に必ず、情報提供用紙をご送付ください。弊社より臨床検体専用の輸送箱をご案内いたします。
  ・解析検体ならびに依頼書を下記検体送付先へご送付ください。
  ・検体は乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

• ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わる検体は、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
  詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。
• お客様よりご提供いただいた検体・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
• 解析依頼書にご記載いただく検体名称およびグループ名称には、文字種や命名方法に関する制約がございます。依頼書記載の命名規定に沿わない名称は解析エラーの原因となる可能性があるため、弊社にて修正させていただく場合がございます。あらかじめご了承ください。