トランスジーンの挿入位置同定

細胞や動物の安全性評価や品質確認に

■お問い合わせ窓口(A)

TEL:077-565-6999

特長

  • ゲノムワイドなシーケンスにより、トランスジーン位置を網羅的に解析
  • トランスジェニック動物やノックイン細胞の解析に

概要

ウイルスベクターを用いて製作されたiPS細胞の安全性評価、トランスジェニックマウスのトランスジーン挿入位置同定による品質確認、CHO細胞のトランスジーン挿入位置同定による生産性評価、モバイルエレメントの挿入位置同定による育種研究などに有効です。

サービス内容

  • 全ゲノムシーケンスを用いた方法
    350 bp程度にランダムに断片化したゲノムDNAからライブラリーを調製し、イルミナ社シーケンサーを用いて全ゲノムシーケンスを実施いたします。取得したデータは挿入配列と参照ゲノム配列へマッピングし、両方にマッピングされたリード情報(Discordant reads [d])およびブレイクポイントをまたぐリード情報(Split reads [s])から挿入位置を検出、挿入位置の情報を納品いたします。

    全ゲノムシーケンス

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 挿入位置候補リスト、挿入図、マッピング結果等

トランスジーン挿入図

トランスジーン挿入図

ご注文方法

オンライン注文とメール注文の2種類からお選びください。
相乗り:短納期プランをご利用の場合は、必ずオンライン注文からご注文ください。

  • オンライン注文
    WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
    WEB会員登録していただくと、簡単にウェブからご注文いただけます。注文履歴の確認やウェブ納品などのサービスもご利用いただけます。
    ※ 生物種、サンプル形態によっては対応していないものがございます。その場合は見積書をご用意の上、ご依頼方法をご案内いたしますので、お問い合わせください。
    ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
    「オンラインのご注文方法について」
    ※オンライン注文ページは Internet Explorer11.0のバージョンのブラウザで動作確認をしております。それ以前のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。 また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。

  • メール注文
    ・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
    ・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    ※WEB会員にログインした状態で、解析依頼書をダウンロードいただきますと、登録情報が依頼書に反映されます。

  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書(オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物)を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・送付サンプルがRNAの場合には、凍結状態を維持するために十分量のドライアイスを同梱し冷凍便で、送付サンプルがDNAの場合には-20℃の状態の冷凍便でお送りください。

受入サンプル

  • 参照ゲノム配列や挿入遺伝子配列情報
  • ゲノムDNA
    以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

    サンプル量 濃度 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    ゲノムDNA 2 μg以上 40 ng/μl以上 1.6以上

    DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
    電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。
    上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

ご留意事項

供与核酸の品質によっては再提供をお願いすることがあります。
ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。