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mRNA Cap 2’-O-Methyltransferase (50 U/μl) | 2,500 U |
10× Capping Buffer | 100 μl |
S-adenosylmethionine (SAM) (32 mM) | 100 μl |
1× | Capping Buffer | |
1 mM | DTT | |
13.75 μCi/ml | [3H]SAM | |
2 μg/50 μl | 100 nt Cap-0 RNA |
Denatured Cap-0 RNA (10 μg)*1、4 | 16 μl | |
10× Capping Buffer | 2 μl | |
SAM (4 mM, dilute 32 mM stock to 4 mM)*2 | 1 μl | |
mRNA Cap 2’-O-Methyltransferase (50 U/μl) | 1 μl | |
Total | 20 μl | *3 |
Denatured RNA transcripts (10 μg)*1、4 | 14 μl | |
10× Capping Buffer | 2 μl | |
GTP (10 mM) | 1 μl | |
SAM (4 mM, dilute 32 mM stock to 4 mM)*2 | 1 μl | |
Vaccinia Capping Enzyme (10 U/μl) | 1 μl | |
mRNA Cap 2’-O-Methyltransferase (50 U/μl) | 1 μl | |
Total | 20 μl | *3 |
*1 | 使用するRNAは5’末端が複雑な2次構造を取る場合に備え、反応前に熱変性する。 <熱変性>
|
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*2 | SAMは不安定であるため、反応前に必要分を32 mMのストック溶液からRNase-free waterで希釈調製する。希釈液は反応まで氷上で保存する。 | ||||
*3 | 必要に応じてスケールアップ可能。 | ||||
*4 | RNAの長さが200 nt以下である場合は、メチル化効率(およびcap付加効率)を上げるため反応時間を延長する(1時間→2時間)。 |
注: | 反応液中のRNAを安定的に保つため、RNase inhibitorが使用できます。使用する場合は、最終濃度が1 U/μlとなるように添加してください。 |
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1-step反応系と2-step反応系:目的に応じたRNAの5’-Cap修飾方法の使い分け
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SP6 RNA Polymerase
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