total RNAを提供いただき、SMART-Seq mRNAとNextera XT DNA Library Prep Kit(イルミナ社)を用いてライブラリー作製を行います。作製したライブラリーはNovaSeqシーケンサー(イルミナ社)を用いてシーケンスします。ヒト・マウスの場合は、シーケンスデータを参照ゲノム配列にマッピングし、遺伝子単位・transcript単位の遺伝子発現量解析も行います。
組織・細胞を提供いただき、弊社で核酸抽出後に短納期RNA-Seq解析にて解析することも可能です。
※RNA-Seq解析については
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<検体ご送付から納品までの流れ>
<短納期プランの注意事項>
■ 解析の流れ・再解析について
- ライブラリー作製ができた検体について、解析を実施いたします。
- 品質検定結果は納品データ内のレポートにてご報告いたします。
- 品質検定で基準未満の検体があった場合は、再解析対応が可能です。
再解析対応の流れについては、データ納品時に個別に案内いたします。
〈品質検定基準〉
- TapeStation 総量:1 ng以上
- 濃度:0.27 ng/µl以上
- RINe:6以上
■ 納期が「短納期(2~4週間)から追加」となるケース
以下①~④に該当する場合は、事前にご相談ください。
①品質検定結果を確認後に、解析検体を選択されたい場合
②事前に受け入れ基準(50 ng、1.7 ng/μl、30 μl)を満たさないことが分かっている場合
③受け入れ可能な検体数が上限に達した場合
④弊社指定以外の1.5 mlチューブまたはプレートをご使用の場合
■ その他注意事項
- RNA検体の返送は対応しておりません。必要分を分注してご送付ください。
- 解析が中止となる場合、それまで実施した作業分の費用を申し受けます。
- 納品予定カレンダーは、受託状況により変更となる場合があります。
ヒト・マウスの場合は遺伝子発現量解析まで実施します。(追加納期なし)
それ以外の生物種の場合はシーケンスまでの実施(fastqファイル納品)となります。
遺伝子発現量解析もご希望の場合は、オプションでご依頼ください。
※データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
※作製済みライブラリー提供シーケンスのみのご依頼を希望の場合は
こちら
【遺伝子発現量解析】
参照ゲノム配列にシーケンスリードをマッピングし、各遺伝子・transcriptの発現量を算出したファイルを納品いたします。
遺伝子発現量解析の価格は、解析に使用する参照ゲノム配列により変動いたします。ヒト・マウス以外の場合はご相談ください。
<解析スケジュール>
◆ … 検体到着期限日(この日の午前中までの必着で送付してください。オンライン注文は、到着期限の前営業日の正午までに行ってください。)
● … データ発送予定日(発送予定日は状況により前後する場合がございます。)
◆の午前中までの検体到着で、●発送予定
※発送予定日は前後する場合がございます。
※核酸抽出からご依頼の場合は、核酸抽出作業が終了後、直近のスケジュールにて対応します。
※情報解析をあわせてご依頼の場合は、カレンダー発送予定日より追加納期をいただきます。
※オンライン注文時の情報入力に不備があった場合や、受け入れ検体数(※検体到着順)が上限に達した場合、次のスケジュールでの実施となります。